賴清德總統於2025年11月30日上午主持了台大雲林分院虎尾院區二期醫療大樓的開工動土儀式。該項目是雲林縣歷來最大規模的醫院擴建計劃，總經費高達129億元。賴總統在儀式上表示，中央將全力支持該項目的建設，期許二期大樓完工後成為醫療燈塔，為雲林及周邊縣市的民眾提供更好的醫療服務。
二期醫療大樓的規劃始於2016年，初期工程經費預計為65億元。然而，由於疫情及物價上漲的影響，經費已增至99.6億元，最終總經費達到129億元。目前，中央已承擔了11.48億元的醫療設備費用，其餘117億多元的工程費用則由中央、雲林分院和台大總院共同承擔。
台大雲林分院長馬惠明在致詞中指出，新醫療大樓將建地上10層、地下3層，提供531張病床。大樓將新增複合式手術室、加護病房、急診重症處置空間及研究教學區域等設施。設計上特別強調疫情時代的醫療需求，設置訪客、醫護、感染、污物、急診與物流六大分流動線，並增設負壓與隔離病房，導入醫療服務機器人、智能運補系統及管理功能，大幅提升醫院的醫療能力。
馬惠明進一步表示，二期大樓預計於2029年底完工。屆時，雲林分院的斗六、虎尾院區合計將擁有1477張病床，達到醫療中心的規模，為周邊地區的民眾提供更全面的醫療照顧。
雲林縣長張麗善感謝中央的支持，表示這是雲林鄉親多年的期盼，希望未來能有更多醫療資源進駐雲林。立委劉建國也表示，隨著醫療資源的提升，更多病患將不必遠赴他地就醫，台大雲林分院有望成為中部地區重要的醫療支點。立委張嘉郡則感謝台大雲林分院對地方的付出，祝願工程順利進行，早日造福鄉親。
賴清德總統回憶自己在成大醫院擔任住院醫師時，經常接診來自雲林的重大急症患者，對家屬的奔波感到不捨。他強調，新醫療大樓的完工將使雲林成為雲嘉南地區的醫療燈塔，為當地及周邊縣市的民眾健康帶來重大貢獻，並再次強調中央將全力支持該項目的建設。